1.口腔：足月新生儿在出生时已有舌乳头，唇肌、咀嚼肌、两颊脂肪垫发育良好，故生后即具有较好的吸吮能力和吞咽功能；早产儿则较差。新生儿出生时唾液腺发育不够完善，唾液及唾液中淀粉酶分泌不足，导致口腔粘膜干燥而易受损及不宜喂淀粉类食物。此外，婴儿可出现生理性流涎。
2.食管、胃：新生儿食管下端贲门括约肌发育不成熟，控制能力差，不能有效的抗反流，常发生胃食管反流，一般九个月时消失。婴儿胃呈水平位，奔门括约肌发育不成熟、幽门括约肌发育良好，婴儿吸奶时常同时吸入空气，故易导致溢乳和呕吐。胃排空时间因食物种类不同而不同。一般水为1.5～2小时，母乳2～3小时，牛乳为3～4小时。早产儿胃排空慢，易发生胃潴留。胃容量出生时30～60ml，1～3个月90～150ml，1岁时250～300Inl。
3.肠道：肠婴儿肠道相对较长，分泌面及吸收面较大，有利于消化吸收。但固定差，易发生肠套叠。早产儿肠乳糖酶活性低、肠壁屏障功能差和肠蠕动协调能力差，因此，易发生乳糖吸收不良、细菌经肠粘膜吸收引起全身性感染和粪便滞留或功能性肠梗阻。
4.胰腺：出生时胰液分泌量少，3～4个月时增多。但胰淀粉酶活性较低，1岁后才接近成人，故不易过早地（生后3个月以前）喂淀粉类食物。新生儿及幼婴胰脂肪酸和胰蛋白酶的活性都较低，故对脂肪和蛋白质的消化和吸收不够完善。
5.肝：年龄越小肝相对越大。新生儿肝在右肋缘和剑突下易触及；但肝细胞和肝功能不成熟。解毒能力差。在传染病、心功能衰竭、中毒等情况下易发生肝肿大变性。婴儿期胆汁分泌较少，影响脂肪的消化和吸收。
6.肠道细菌胎儿消化道内无细菌，出生后细菌很快从口、鼻、肛门侵入肠道，大多集中在大肠及直肠内。而肠道菌群受食物成分影响，母乳喂养者以双歧为主；人工喂养者以大肠埃希菌（大肠）为主。正常肠道菌群对侵入肠道的致病菌有一定的桔抗作用。消化道功能紊乱时，肠道细菌大量繁殖可进入小肠甚至胃而致病。
7.粪便：小儿粪便新生儿最初排出的大便为深墨绿色、粘稠、无臭味，称胎粪。胎粪由胎儿肠道脱落的上皮细胞、消化液及吞下的羊水组成，多数生后12小时内开始排便，总量为100～200g，2～3天渐过渡为黄糊状粪便。如24小时内无胎粪排出，应注意检查有无肛门闭锁等消化道畸形。母乳喂养儿粪便为金黄色，糊状，不臭，呈酸性反应，每日2～4次。牛、羊乳喂养儿粪便为淡黄色，较干厚，有臭味，呈中性或碱性反应，每日1～2次。添加谷类、蛋、肉、蔬菜等辅食后大便，接近成人，每日1次。
